Сергей Кустов родился 11 октября 1971 года в селе Грабово Бессоновского района Пензенской области. Окончил среднюю школу №2 и поступил в Казанское высшее танковое командное Краснознаменное училище, по окончании которого 1992 году был распределен во внутренние войска МВД России.

Ему очень хотелось служить в разведке, и он осуществил свою мечту в разведроте одной из дивизий оперативного назначения. Своим среди сослуживцев стал быстро, не раз доказывал, что с ним можно идти на самые опасные и ответственные задания.

В 1992 году лейтенант Сергей Кустов вместе с подчиненными выполнял боевые задачи в районе осетино-ингушского конфликта. Затем была специальная командировка в Чечню, в которой он провел в общей сложности более года. За отвагу и самоотверженность, проявленные в ходе контртеррористической операции, офицер был награжден медалью ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени (с изображением мечей).

Во время так называемой второй чеченской кампании, когда в январе 2000 года под Мескер-Юртом одно из подразделений попало в засаду, многих военнослужащих спасло хладнокровие начальника разведки. Сам он был ранен в ногу, но остался в боевых порядках и успешно руководил боем. За проявленное мужество Сергей был представлен к государственной награде.

В октябре 2001 года майор Сергей Кустов отметил тридцатилетие. Его контракт с воинской частью подходил к концу, и он решил продолжить службу в милиции. Офицеру предложили должность заместителя командира Пензенского СОБРа. 1 декабря он должен был приступить к выполнению служебных обязанностей уже на новом месте, но еще предстояла командировка в Чечню.

В ходе этой командировки майор Сергей Кустов возглавил восемь засад и тринадцать разведывательных и оперативно-поисковых мероприятий. В результате было уничтожено 19 вооруженных боевиков, изъято 17 единиц автоматического оружия, карабин, 4 пистолета, 8 гранатометов, большое количество боеприпасов и взрывчатых веществ.

Сослуживцы вспоминали, что в ночь с 22 на 23 ноября группа майора Сергея Кустова совместно с сотрудниками временного отдела внутренних дел Шалинского района проводила адресную проверку в населенном пункте Автуры. Сергей сумел лично задержать боевиков, готовившихся оказать вооруженное сопротивление.

После проведения оперативно-поисковых мероприятий группа отправилась на базу и на восточной окраине населенного пункта Шали попала в засаду. Свой огонь бандиты сосредоточили на головной машине, где находился командир группы.

Экипаж бронетранспортера спешился и принял бой. В ходе боя майор Сергей Кустов получил тяжелое ранение, но продолжил руководить действиями подчиненных. Благодаря его решительным действиям, подразделение смогло продержаться до подхода подкрепления и затем выйти в безопасный район. Однако в ходе эвакуации майор Сергей Кустов от полученных ранений скончался.

За проявленные при исполнении воинского долга мужество и отвагу в условиях, сопряженных с риском для жизни, майор Сергей Кустов посмертно представлен к званию Героя Российской Федерации. Однако в связи с реорганизацией воинской части, где служил Сергей, и тем обстоятельством, что его документы уже были переданы на перевод в СОБР, представление не было реализовано.

Спустя 11 лет подвиг офицера был по достоинству оценен, и представление на звание Героя Российской Федерации было направлено для реализации в администрацию Президента Российской Федерации.

Память о майоре Сергее Кустове свято чтут его боевые друзья, родные и близкие. В школе, которую окончил Сергей, установлена мемориальная доска. Среди старшеклассников проводятся спортивные соревнования по стрельбе на кубок Сергея Кустова, учрежденный районной администрацией.

12 июля 2012 года Президент Российской Федерации подписал Указ о присвоении звания Героя России майору Сергею Викторовичу Кустову (посмертно).